Heute sind alle Benediktinerklöster zu einer Einheit zusammengeschlossen, der sogenannten Benediktinischen Konföderation, an deren Spitze ein Abtprimas steht, der in Rom residiert. Diese Organisation ist relativ neu: Sie geht auf den Kadetten Leo XI. zurück und stammt aus dem Jahr 1893.

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Ursprünglich hatte der Heilige Benedikt keine strukturierte Organisation zwischen den Klöstern vorgesehen: Jedes lebte völlig autonom unter dem wachsamen Auge des örtlichen Bischofs. Aus verschiedenen Gründen schlossen sich im Laufe der Jahrhunderte einige Klöster zusammen, sei es, weil sie geografisch nahe beieinander lagen, weil sie aus anderen Klöstern hervorgegangen waren und gemeinsame Observanzen hatten, oder aus noch weniger Gründen. So erreichten im 9. Jahrhundert unter der Ägide der karolingischen Monarchen und Benedikt von Aniane Klöster untereinander eine gewisse Union mit einheitlichen Gebräuchen. Ein Jahrhundert später schlossen sich zahlreiche Klöster unter der Ägide des Klosters Cluny zusammen.

Jahrhundert hatten sich die Zisterziensermönche unter der Führung des heiligen Bernhard zu einem echten, strukturierten und hierarchisch organisierten Orden zusammengeschlossen; als sie die Vorteile eines solchen Zusammenschlusses erkannten, versuchten einige Benediktiner nach ihrem Vorbild, sich ebenfalls nach Regionen zusammenzuschließen. Die Bewegung war jedoch weit davon entfernt, allgemein zu sein. Jahrhundert versuchte Papst Benedikt XII., die Grundsätze der Vereinheitlichung und Zentralisierung auf alle Benediktiner anzuwenden, um die Bewegung wieder in Gang zu bringen. Dies gelang ihm jedoch nur teilweise. Einige Abteien schlossen sich jedoch nach Ländern zusammen und gründeten Kongregationen mit nationalem Charakter. So entstanden die englischen, italienischen, ungarischen usw. Kongregationen. Sie blieben über alle politischen Wechselfälle hinweg bestehen.

Papst Leo XIII. war um Einheit bemüht und beschloss, diese Kongregationen in einer einzigen Organisation zu vereinen: Er verfügte 1893 die Gründung der „Benediktinischen Konföderation“. Die Kongregationen, die auf ihre Privilegien und ihre Traditionen eifersüchtig waren, behielten jedoch ihre eigene Struktur und interne Organisation bei. So befürworteten einige das zeitlich begrenzte Abtsein, während andere das lebenslange Abtsein beibehielten; in einer Kongregation gab es nur ein einziges Noviziat für alle Klöster, während es in einer anderen so viele Noviziate wie Klöster gab; in einer Kongregation war das Pfarramt allgemein üblich, während es in anderen die Ausnahme war; das missionarische Apostolat war das Merkmal einer Kongregation, während es in einer anderen kategorisch ausgeschlossen war, usw. Die Kongregation war nicht in der Lage, das Apostolat auf eine bestimmte Art und Weise auszuüben. So behielt jede von ihnen ihre Rechte und ihre Besonderheit. Kurzum, jede Benediktinerkongregation (heute gibt es 20) organisierte sich als autonomer religiöser Orden mit eigenen Leitungsinstanzen: ihrem Generaloberen (je nach Fall Abtpräsident, Generalabt oder Erzabt), ihrem Generalkapitel (höchste gesetzgebende Instanz), ihren eigenen Konstitutionen usw. Die Benediktinerkongregationen waren in der Lage, sich selbst zu organisieren, indem sie ihre eigenen Regeln und Regeln aufstellten, die von den Ordensmitgliedern selbst festgelegt wurden.

Die Kongregationen sind unterschiedlich groß. Einige umfassen mehr als tausend Mönche, andere nur etwa hundert. Auch die Anzahl der Klöster ist unterschiedlich: Die ungarische Kongregation hat nur eine große Abtei in Ungarn und eine neu gegründete in Brasilien; die Kongregation von Subiaco hingegen ist in mehreren europäischen Ländern, in Afrika, auf den Philippinen und in Vietnam so weit verbreitet, dass sie in mehrere Provinzen aufgeteilt ist. Einige Kongregationen blicken auf eine jahrhundertelange Geschichte zurück, wie die Kongregationen von Vallombreuse oder Camaldoli, andere sind neueren Datums, wie die 1976 gegründete Kongregation Cono-Sur (Lateinamerika).

Obwohl sich die benediktinischen Kongregationen in ihrer Struktur und ihren Aktivitäten voneinander unterscheiden, sind sie doch alle zutiefst vom benediktinischen Geist beseelt und wollen das, was der heilige Benedikt in seiner Regel vorschlägt, aktualisieren. Es gibt genügend Gemeinsamkeiten zwischen ihnen, um sie zu einer benediktinischen „Familie“ zusammenzufassen. Er residiert in der Abtei San Anselmo in Rom und vertritt die Konföderation beim Heiligen Stuhl.

Hier ist eine Liste der konföderierten Benediktinerkongregationen :

1) Kongregation von Montecassino: entstand aus der alten Kongregation von St. Justina, die 1408 gegründet wurde. Diese Kongregation wurde am 7. Februar 2013 in die Kongregation von Subiaco eingegliedert. Die Kongregation von Subiaco wird zur Kongregation Subiaco-MonteCassino.

2) Englische Kongregation, gegründet 1336 und 1619 wiederhergestellt.

3) Ungarische Kongregation, gegründet 1514 und 1639 wiederhergestellt.

4) Schweizer Kongregation, gegründet 1602.

5) Österreichische Kongregation, errichtet 1625.

6) Bayerische Kongregation, gegründet 1684.

7) Brasilianische Kongregation, die aus der portugiesischen Kongregation hervorgegangen ist und 1827 errichtet wurde.

8) Kongregation von Solesmes, errichtet 1837.

9) Amerikanisch-Montecassino Kongregation, errichtet 1855.

10) Kongregation von Subiaco, errichtet 1872, aufgeteilt in 9 geografische Provinzen. Nach der Eingliederung der Kongregation von Montecassino im Februar 2013 nennt sich die Kongregation Subiaco-Mont-Cassin (oder Subiaco-Cassinaise).

11) Kongregation von Beuron, errichtet 1873.

12) Helvetisch-amerikanische Kongregation, errichtet 1881.

13) Kongregation von Sankt Ottilien, gegründet 1884.

14) Kongregation der Verkündigung des Herrn, gegründet 1920.

15) Slawische Kongregation, errichtet 1945.

16) Kongregation von Monte Olivet, gegründet 1319.

17) Kongregation von Vallombrosa, gegründet 1036.

18) Kongregation von Camaldoli, errichtet 1113.

19) Kongregation der Silvestriner, gegründet 1231.

20) Kongregation von Cono-Sur, errichtet 1976.

Einige Klöster, die nicht der Kongregation angehören, sind von der Kirche abhängig.